一級生物安全柜可保護工作人員和環境而不保護樣品。其氣流原理和實驗室通風櫥基本相同，不同之處在于排氣口安裝有HEPA 過濾器，將外排氣流過濾進而防止微生物氣溶膠擴散造成污染。一級安全柜本身無風機，依賴外接通風管中的風機帶動氣流，由于不能保護柜內產品，目前已較少使用。二級安全柜是目前應用的柜型。按照《中華人民共和國醫藥行業標準YY0569-2005生物安全柜》中的規定，二級依照入口氣流風速、排氣方式和循環方式可分為4 個級別：A1 型，A2 型，B1 型和B2 型。所有的二級都可提供工作人員、環境和產品的保護。不論是一級還是二級，都需及時清潔消毒。